Ο Παναθηναϊκός έχει ξοδέψει πακτωλό χρημάτων το προηγούμενο καλοκαίρι φέρνοντας ό,τι καλύτερο κυκλοφορύσε στην Ευρωπαϊκή αγορά. Ρέμπρατσα, Κάτας, Ρότζερς και προπονητής ο Ζέλικο Ομπράντοβιτς. Η ομάδα ήταν επιβλητική από την αρχή της σεζόν και δεν άφησε περιθώρια αμφισβήτησης. Κάπως έτσι έφτασε στην κατάκτηση του δεύτερου Ευρωπαϊκού νικώντας την Μακάμπι Τελ Αβίβ με 73-67. Το ματς κρίθηκε στις λεπτομέρειες και εκείνος που πέτυχε το καθοριστικό σουτ ήταν ο Όντεντ Κάτας, που αγωνιζόταν κόντρα στην παλιά του ομάδα, αλλά τελικά ήταν αυτός που τη… σκότωσε! Αυτό βέβαια δεν πτόησε τους οπαδούς των Ισραηλινών να αποθεώσουν ένα «δικό τους» παιδί.

Αντίπαλος του «τριφυλλιού» στον ημιτελικό ήταν η Εφές Πίλσεν του Ιμπραϊμ Κουτλουάι, που δεν κατάφερε να αποτελέσει σημαντικό εμπόδιο για τον Παναθηναϊκό και τελικά γνώρισε την ήττα με 81-71.
Το Final 4 είχε διεξαχθεί στην Πυλαία της Θεσσαλονίκης και σε αυτό μετείχαν Παναθηναϊκός, Μακάμπι Τελ Αβίβ, Εφές Πίλσεν και Μπαρτσελόνα.
Αξίζει να σημειωθεί ότι η σεζόν 1999/2000 ήταν η πρώτη του Ζέλικο Ομπράντοβιτς στον πάγκο του Παναθηναϊκού!

Παναθηναϊκός (Ομπράντοβιτς): Τζεντίλε 3, Αλβέρτης 4, Μποντιρόγκα 9, Ρότζερς 4, Ρέμπρατσα 20, Κάτας 17, Φώτσης 9, Μπερκ 7, Κοχ
Μακάμπι Τελ Αβίβ (Γκέρσον): ΜακΝτόναλντ 11, Σαρπ 5, Χένεφελντ, Χάφμαν 26, Κόμετζις 3, Μπρίσκερ 13, Τζάμσι 3, Σέφερ 6, Σέλεφ, Πόπα